C'est simple : le répertoire n'est pas vide et votre programme FTP cache les fichiers commençant par un point ( et qu'on appelle les fichiers cachés )
Solution 1 : modifier les paramètres du programme FTP pour voir ces fichiers et pouvoir les supprimer avant d'effacer le dossier
Solution 2 : utilisez le filemanager pour l'effacer. Point de départ : un lien dans la page focus du domaine, les codes y sont